Bioinformatician (Single-cell Sequencing)

Ключевые навыки

О нас. ImmunoMind - биотехнологический стартап из Беркли, Калифорния в сфере вычислительной иммунологии. Наша миссия – объединить иммунологию и ИИ чтобы сделать разработку персонализированных лекарств доступной большему числу фарма и биотех компаний. Мы прошли через топ-5 акселератор Кремниевой Долины Berkeley SkyDeck (1% рейт приема). Наш продукт - платформа для быстрого и сверх-точного анализа данных иммунной системы для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях.

Что нужно делать? Помогать в разработке ультра-быстрой библиотеки (на GPU и кластерах) для анализа single-cell sequencing данных с текущим фокусом на транскриптомике в раке, аутоиммунных и орфанных заболеваниях, а также пайплайнов для разработки лекарств и поиска их побочных эффектов. Мы ищем опытного биоинформатика с опытом в HTS и омиксных технологиях с интересом и желанием развиваться в сторону управления командой биоинформатиков.

Кого ищем? Человека с опытом в HTS и омиксной биоинформатике с интересом и желанием развиваться в сторону управления командой биоинформатиков.

Куда расти? Старший биоинформатик по single-cell, тимлид команды биоинформатиков, директор по single-cell биоинформатике. Смежные области, куда можно развиваться: продуктовый менеджмент, immunogenomics биоинформатика, Machine Learning / Deep Learning / Data Science.

Условия и требования:

• Полностью удаленная работа, используем GitHub / Notion / Slack / Zoom для коммуникации и менеджмента.
• Большой фокус на индивидуальном подходе к коллегам: регулярные встречи и планирование карьерного развития.
• Вилка: $1200 - 2500, опционная программа.
• Критичные требования:
  • Уверенное владение R/Python для биоинформатики
  • Опыт работы с биоинформатическими базами данных NCBI, EMBL-EBI, MSigDB
  • Опыт завершённого проекта по анализу данных эксперимента с RNA sequencing – от fasta до результатов
  • Вы ответственны и держите обещания. Если что-то не получается или есть сложности - смело говорите об этом.
  • У вас есть мотивация решать сложные задачи в биомедицине.
• Плюсом будет опыт и умение разработки чистого, документированного, производительного и покрытого тестами кода.

Задачи:

• Анализ данных single-cell RNA sequencing экспериментов для поиска новых мишеней для лекарств и их побочных эффектов
• Анализ публикаций и разработка пайплайнов на основе лучших практик
• Составление спецификации биоинформатических алгоритмов и методов анализа для инженеров и разработчиков
• Описание результатов исследований в виде научных статей и блог-постов
• Коммуникация с клиентами, коллабораторами и членами сообщества

Как связаться:

• Выслать резюме
• Задать вопрос